数据集概述
本数据集为论文Sneberger et al.相关研究的口腔微生物组测序原始数据，包含牙结石样本的微生物组测序结果，涉及序列聚类、序列标题、文档及OTU表格等5个文件，可用于口腔微生物组重建与INNUL分析相关研究。
文件详解
- 序列聚类文件（.fas格式）
- 文件名称：POSPISEK_joined_qm30_primersRemoved_min240max270_clustered.fas、POSPISEK_joined_qm30_primersRemoved_min240max270_clustered_mostAbund.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：包含经过引物去除、长度筛选（240-270bp）和聚类处理的微生物序列数据，其中“mostAbund”文件为高丰度序列数据
- 序列标题文件
- 文件名称：Sequence titles.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含序列ID（如M03794:20:000000000-ATUED:1:2102:24862:22369）、样本编号（如POS001）、聚类编号（如CL1460）等信息
- 文档文件
- 文件名称：Sequences.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含测序序列相关的文档说明内容
- OTU表格文件
- 文件名称：OTUs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含操作分类单元（OTU）相关的表格数据
数据来源
论文“Sneberger et al., A combined method for oral microbiome reconstruction and INNUL profiling from dental calculus samples”
适用场景
- 口腔微生物组结构分析：利用聚类序列数据研究牙结石样本中微生物群落的组成与丰度特征
- 微生物组重建方法验证：基于原始测序数据验证口腔微生物组重建的联合方法效果
- INNUL分析模型构建：结合测序数据开展INNUL（特定微生物分析指标）的特征分析与模型开发
- 口腔微生物与健康关联研究：通过OTU表格数据探索口腔微生物与口腔健康或疾病的潜在关联
- 古口腔微生物研究：若样本为古牙结石，可用于古代人群口腔微生物组的演化分析（需结合样本背景）
