数据集概述
本数据集包含对淡水黄貂鱼Potamotrygon motoro和Potamotrygon falkneri两种物种的单核苷酸多态性（SNP）标记识别与验证数据。通过ddRAD技术获取454测序数据，筛选出143个候选SNP，其中82个成功验证，61个具有多态性，可用于种群分析和杂交检测。数据集共包含4个文件。
文件详解
- Information_samples.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含实验样本的基本信息，用于记录样本来源、编号等基础数据
- Table_information_NCBI(SRA).docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：NCBI SRA数据库相关的表格信息文档，记录测序数据的存储与访问信息
- Genotypes_variants.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基因型变异数据，记录SNP标记的基因型信息与变异位点
- 454_contigs.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：454测序获得的contigs序列数据，包含contig编号、长度、读取数及核苷酸序列信息（如>contig00001 length=883 numreads=18及后续序列）
数据来源
论文“Identification and validation of single nucleotide polymorphisms as tools to detect hybridization and population structure in freshwater stingrays”
适用场景
- 淡水黄貂鱼种群遗传学研究: 分析Potamotrygon motoro和Potamotrygon falkneri的种群结构与遗传多样性
- 杂交检测应用: 利用物种特异性SNP标记识别两种淡水黄貂鱼的杂交个体
- 分子标记开发: 基于验证的SNP标记，为淡水软骨鱼类开发种群分析工具
- 水生生物保护遗传学: 为淡水黄貂鱼的保护策略制定提供遗传数据支持
