数据集概述
本数据集为野生番茄(Solanum sect. Lycopersicon)叶片表型的数量遗传分析数据,包含叶片性状相关的数量性状位点(QTL)定位、基因序列比对及PAML分析结果,用于研究叶片表型的自然选择机制及适应性进化遗传基础,共含2个文件。
文件详解
- README_for_dryaddata.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集说明,提及文件包括paml.ctl(PAML控制文件)、stomatal_gene_alignments.maf(基因多序列比对文件)、Solyc#####.rst(基因PAML结果文件)、gene_ids.list(基因ID与名称对应文件)
- dryaddata.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,包含野生番茄叶片表型数量遗传分析相关的基因序列、比对结果及PAML分析数据
数据来源
论文“Quantitative genetic analysis indicates natural selection on leaf phenotypes across wild tomato species (Solanum sect. Lycopersicon; Solanaceae)”
适用场景
- 植物适应性进化研究:分析野生番茄叶片表型的自然选择机制及遗传基础
- 数量性状位点定位:利用QTL数据研究叶片性状与气候适应的关联
- 基因功能分析:通过PAML结果及序列比对数据探究气孔发育相关基因的进化
- 植物遗传育种:为番茄抗逆性育种提供叶片表型适应性进化的遗传参考