SpaceXR_Galaxy_Based_生物医学测试数据完整集合

数据集概述

该数据集为spacexr Galaxy包装器测试数据,包含27个文件,涉及细胞、基因相关生物医学内容,涵盖表格数据、R语言数据文件、PDF文档及R代码等多种类型,为测试相关工具或流程提供数据支持。

文件详解

  • 表格数据文件(.tabular格式,共6个):
  • metadata.tabular:元数据表格
  • coords.tabular:坐标数据表格
  • barcodes.tabular:条形码数据表格
  • sc_count.tabular:单细胞计数数据表格
  • st_count.tabular:空间转录组计数数据表格
  • de_genes_Astrocytes_two_regions:无扩展名表格,含星形胶质细胞两区域差异基因数据
  • R语言数据文件(.rds格式,共5个):
  • rds_doublet.rds: doublet相关R数据文件
  • cside.rds:cside相关R数据文件
  • myRCTD_merfish.rds:RCTD与merfish相关R数据文件
  • rds_multi.rds:多组学相关R数据文件
  • PDF文档(.rds格式,共14个):
  • all_cell_types_d.pdf:细胞类型相关PDF文档
  • all_doublets_type_d.pdf:doublet类型相关PDF文档
  • nUMI_plot.pdf:UMI计数绘图PDF文档
  • cell_type_weights_doublets_d.pdf:doublet细胞类型权重PDF文档
  • cell_type_weights_unthreshold_d.pdf:未阈值化细胞类型权重PDF文档
  • 代码文件(.r格式,共1个):
  • doublet.R:doublet分析相关R代码文件

适用场景

  • 生物信息学工具测试:用于spacexr Galaxy包装器功能测试与验证
  • 单细胞数据分析:支持细胞计数、基因表达等相关分析场景
  • 空间转录组研究:可用于空间转录组数据处理流程测试
  • 生物医学数据可视化:基于PDF文档探索细胞类型、基因表达等可视化结果
  • R语言数据分析流程验证:通过R代码与数据文件验证相关分析逻辑
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 18.37 MiB
最后更新 2025年12月8日
创建于 2025年12月8日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。