数据集概述
本数据集包含Spo11和Msh4-1相关的蛋白质组学质谱原始数据与分析结果，基于MaxQuant生成的proteinGroups和evidence文件进行处理，涵盖归一化、Top3强度计算、差异分析等步骤，共4个Excel文件，用于蛋白质组学差异表达研究。
文件详解
- 原始数据文件
- 文件名称：Mass spec Spo11_raw.xlsx、Mass spec_ MSH4_1raw.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含MaxQuant生成的proteinGroups和evidence数据表，作为质谱原始数据记录
- 分析结果文件
- 文件名称：Mass spec Spo11_analysed.xlsx、Mass spec_ MSH4_1analysed.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含差异分析结果表（标记SPO与CTR组显著差异蛋白质）、6列样本Top3强度数据，以及Q值列（建议忽略Q>0的蛋白质）
适用场景
- 蛋白质组学差异表达分析: 基于差异分析结果研究SPO与CTR组的蛋白质表达差异
- 质谱数据标准化方法验证: 验证方差稳定变换（vsn）和Top3强度计算方法的有效性
- 生物信息学工具整合研究: 分析MaxQuant与limma包在蛋白质组学数据分析中的应用流程
- 蛋白质组学实验设计优化: 评估缺失值处理（无插补）对差异分析结果的影响
