数据集概述
本数据集包含为巴塔哥尼亚鲱鱼(Sprattus fuegensis)开发的三十三个微卫星标记的相关信息。通过Illumina双端 shotgun测序技术分离并表征标记,筛选了智利艾森峡湾近岸水域24个个体样本,记录了每个位点的等位基因数、观测杂合度及同一性概率等遗传参数,可用于种群遗传结构分析、有效种群大小估计及渔业管理。
文件详解
- 文件名称:README_for_Sprattusfuegensis_msats.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含数据集的说明文档,可能涵盖微卫星标记的开发方法、样本信息、遗传参数统计及数据使用说明等内容。
- 文件名称:Sprattusfuegensis_msats.rar
- 文件格式:RAR
- 字段映射介绍:压缩归档文件,可能包含微卫星标记的原始测序数据、基因型数据、统计分析结果等核心数据内容。
数据来源
论文“Development and characterization of thirty-three microsatellite markers for the Patagonian sprat, Sprattus fuegensis (Jenyns, 1842), using paired-end Illumina shotgun sequencing”
适用场景
- 种群遗传结构分析: 利用微卫星标记数据研究巴塔哥尼亚鲱鱼的种群分化、基因流及遗传多样性水平。
- 有效种群大小估计: 通过遗传参数计算种群的有效规模,评估种群动态及濒危风险。
- 渔业资源管理: 为渔业资源的可持续开发、保护策略制定及种群监测提供遗传数据支持。
- 分子标记开发参考: 作为鱼类微卫星标记开发的技术案例,为其他物种的分子遗传学研究提供方法借鉴。