数据集概述
本数据集包含StarBeast3软件的基准测试数据集,涵盖3个真实数据集和2个合成数据集,以BEAST 2 XML格式提供,用于验证该软件在多物种溯祖模型下的贝叶斯推断性能,支持系统发育分析相关研究。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:包含数据集说明、StarBeast3安装与运行指引及数据集列表,提及数据集对应文献来源。
- 数据文件
- 文件名称:sim12.xml、barrows.xml、hamilton.xml、bryson.xml、sim48.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:共5个XML文件,均为BEAST 2格式的可运行文件,对应2个合成数据集(sim12、sim48)和3个真实数据集(蛙类、蜘蛛等),用于StarBeast3软件的基准测试。
适用场景
- 系统发育软件性能评估:用于测试StarBeast3在多物种溯祖模型下的贝叶斯推断效率与准确性。
- 多物种溯祖模型验证:通过真实与合成数据集验证该模型在处理基因组序列数据时的可靠性。
- 生物信息学工具对比研究:作为基准数据集,支持不同系统发育推断工具的性能对比分析。
- 基因组数据系统发育分析:利用XML格式的数据集,开展物种演化关系的贝叶斯推断研究。