数据集概述
该数据集为StarDist与TrackMate结合的示例数据,包含乳腺癌细胞的StarDist训练数据集、测试数据集及通过ZeroCostDL4Mic生成的StarDist模型,支持细胞图像分割与追踪相关研究。
文件详解
该数据集包含一个压缩文件,具体说明如下:
- 文件名称: Breast cancer cell dataset.zip
- 文件格式: ZIP (.zip)
- 压缩包内包含:
- 训练数据集:72对荧光显微图像(SiR-DNA标记)及手动分割得到的对应掩码
- 测试数据集:未明确数量的乳腺癌细胞相关图像数据
- StarDist模型文件:通过ZeroCostDL4Mic生成的模型文件
- 图像参数:
- 数据类型:荧光显微图像(16位)、掩码(8位或16位)
- 图像尺寸:1024x1024像素(像素大小:634纳米)
- 显微镜类型:转盘共聚焦显微镜(20倍0.8 NA物镜)
- 细胞类型:DCIS.COM Lifeact-RFP细胞
适用场景
- 生物医学图像分析:用于乳腺癌细胞图像的自动分割算法训练与测试
- 细胞追踪研究:结合StarDist与TrackMate工具实现细胞动态追踪分析
- 显微镜图像处理:验证荧光显微图像分割模型的性能与准确性
- 生物信息学工具开发:为细胞图像分析相关算法开发提供示例数据集