数据集概述
本数据集为棉花染色虫(Dysdercus fasciatus)肠道菌群与共传播锥虫寄生虫(Leptomonas pyrrhocoris)互作研究的相关数据,包含测序数据、实验数据及说明文档,用于分析肠道菌群对寄生虫感染的抑制作用及机制。
文件详解
- 测序数据压缩包
- 文件名称:Dysdercus_sequencing_data.7z
- 文件格式:7z
- 字段映射介绍:包含StarSEQ生成的原始未配对Illumina测序fastq.gz文件,其中以"85"开头的文件为感染锥虫的共生棉花染色虫样本,以"86"开头的文件为未感染锥虫的共生棉花染色虫样本,文件含序列及质量信息。
- 实验数据文件
- 文件名称:Onchuru_et_al_MolEcol_Data.xlsx
- 文件格式:xlsx
- 字段映射介绍:包含研究相关的实验数据,可能涉及寄生虫滴度、发育时间、存活率等实验指标及样本分组信息。
- 说明文档
- 文件名称:README_for_Dysdercus_sequencing_data.txt
- 文件格式:txt
- 字段映射介绍:说明测序数据来源为德国Mainz的StarSEQ,解释fastq.gz文件的样本类型(共生感染组、共生未感染组)及文件命名规则。
数据来源
StarSEQ, Mainz, Germany
适用场景
- 昆虫肠道微生物组研究: 分析棉花染色虫肠道菌群的组成及功能。
- 寄生虫感染机制研究: 探究肠道菌群对锥虫寄生虫感染的抑制作用及屏障机制。
- 微生物-寄生虫互作分析: 研究肠道菌群与锥虫寄生虫的互作关系及对宿主健康的影响。
- 测序数据分析应用: 利用原始测序数据进行肠道菌群多样性、丰度变化等生物信息学分析。