数据集概述
本数据集围绕太平洋海洋三刺鱼的适应性分化展开，包含其遗传变异与表型特征数据。通过对阿拉斯加至加利福尼亚八个地点的250余条三刺鱼进行基因测序与表型分析，探究海洋种群作为淡水种群“当代祖先”的适用性，为研究生态驱动的适应性进化提供数据支持。
文件详解
- 表型数据文件
- 文件名称：plates.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录三刺鱼的骨板数量等表型数据，用于分析表型特征与遗传变异的关联
- 形态学数据文件
- 文件名称：landmark_summary_withAK.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含三刺鱼形态学地标数据，如am01_left_01等样本的形态测量数值，支持体型分析
- 遗传结构数据文件
- 文件名称：adegenet_batch_1.stru、batch_1.stru、marinefw_batch_1.stru
- 文件格式：STRU
- 字段映射介绍：共3个遗传结构文件，存储三刺鱼的基因位点变异数据，用于群体遗传结构分析与聚类研究
数据来源
论文“Contemporary ancestor? Adaptive divergence from standing genetic variation in Pacific marine threespine stickleback”
适用场景
- 群体遗传学研究：分析三刺鱼种群的遗传分化（FST值）与遗传聚类特征
- 适应性进化机制研究：探究遗传变异（如Eda基因）与表型（骨板数量、体型）的关联，揭示适应性分化过程
- 进化生物学方法论验证：评估“当代祖先”种群在适应性进化研究中的适用性
- 海洋生物多样性分析：基于遗传与表型数据，研究三刺鱼的种群结构与地理分布规律
