数据集概述
本数据集围绕日本三刺鱼同域物种对的性染色体周转展开,包含日本海种群(新性染色体系统)与太平洋种群(简单XY系统)的基因组测序相关数据,用于探究性染色体周转在表型分化和基因组进化中的功能作用,涉及基因表达、序列分化等研究维度。
文件详解
- Brain.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含日本三刺鱼脑组织相关的基因表达或序列数据(具体字段未详细说明)
- Testis.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:包含日本三刺鱼睾丸组织相关的基因表达或序列数据(具体字段未详细说明)
- Expression_design.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含ProbeID(探针ID)、Sequence(探针序列)等字段,记录基因表达实验的探针设计信息
- CGH_design.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:推测包含比较基因组杂交(CGH)实验的设计信息(具体字段未详细说明)
数据来源
论文“Sex chromosome turnover contributes to genomic divergence between incipient stickleback species”
适用场景
- 性染色体进化研究:分析三刺鱼新性染色体的形成机制、序列分化及基因积累特征
- 物种分化基因组基础研究:探究性染色体周转在同域物种表型分化与生殖隔离中的作用
- 基因表达差异分析:利用脑、睾丸组织数据研究性别偏向性表达基因的分布规律
- 进化遗传学研究:分析新性染色体上基因的非同义替代率及物种间序列分化模式