数据集概述
本数据集围绕粪便样本储存条件对微生物群落的影响展开研究,对比-80°C冷冻、室温、冷藏箱储存48小时及立即提取四种条件下的微生物群落变化,评估三种DNA提取试剂盒的效果,并通过定量PCR分析主要肠道菌群丰度,为微生物组研究的样本处理标准化提供数据支持。
文件详解
- Quality_and_Purity_results.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含三种DNA提取试剂盒的DNA产量和质量检测结果,可能涉及浓度、纯度(如A260/A280比值)等指标,用于评估不同试剂盒的提取效果。
- Cts.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含样本编号(Sample)、菌群类型(Population)、储存条件(Storage,如I=立即提取、F=-80°C冷冻等)、定量PCR循环阈值(Ct)、重复次数(Replicates)等字段,用于分析不同储存条件下肠道菌群(如Bacteroidetes、Firmicutes)的相对丰度。
数据来源
论文“The effect of storage conditions on microbial communities in stool”
适用场景
- 微生物组样本处理标准化研究:分析不同储存条件对粪便微生物群落结构的影响,为样本储存方案优化提供依据。
- DNA提取试剂盒性能评估:对比三种试剂盒的DNA产量和质量,筛选适用于粪便微生物组研究的提取方法。
- 肠道菌群丰度分析:通过定量PCR数据研究主要肠道菌群在不同储存条件下的丰度变化。
- 临床微生物组研究方法优化:为TB-CHAMP等临床试验中的粪便样本处理提供标准化参考。