数据集概述
本数据集围绕甜瓜硫素 phytotoxicity 耐受性展开,包含基于重组自交系群体的QTL定位结果、KASP分子标记开发数据及相关验证信息,涉及1个主效QTL(qSulf-1)和2个微效QTL,可支持甜瓜抗硫素 phytotoxicity 育种的分子标记辅助选择。
文件详解
- 数据文件组
- 文件名称:SupplementaryTableS1.xlsx、SupplementaryTableS2.xlsx、SupplementaryTableS3.xlsx、SupplementaryTableS4.xlsx、SupplementaryTableS5.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含QTL定位结果、RIL群体表型数据、KASP标记开发信息、标记验证结果等表格数据
- 文件名称:sulfQ1_annovar.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Chr(染色体)、Start/End(位置)、Ref/Alt(碱基)、Func.refGene(功能注释)、Gene.refGene(基因名称)等qSulf-1区间的基因注释信息
- 栅格文件组
- 文件名称:SupplementaryFigureS1.tif、SupplementaryFigureS2.tif、SupplementaryFigureS3.tif
- 文件格式:TIF
- 字段映射介绍:包含QTL定位图谱、标记连锁图、表型数据分布等可视化结果
数据来源
论文“QTL mapping and marker development for tolerance to sulfur phytotoxicity in melon (Cucumis Melo)”
适用场景
- 甜瓜抗逆性育种:用于分子标记辅助选择硫素耐受性甜瓜品种
- 植物生理学研究:分析硫素 phytotoxicity 对甜瓜叶片损伤的遗传机制
- 分子遗传学研究:解析qSulf-1等QTL区间的候选基因功能
- 农业生产应用:指导甜瓜种植中的硫素 fungicide 合理使用
数据文件清单
- SupplementaryTableS1.xlsx:QTL定位结果表
- SupplementaryTableS2.xlsx:RIL群体表型数据表
- SupplementaryTableS3.xlsx:KASP标记开发信息表
- SupplementaryTableS4.xlsx:标记验证结果表
- SupplementaryTableS5.xlsx:QTL区间候选基因表
- sulfQ1_annovar.csv:qSulf-1区间基因注释数据
- SupplementaryFigureS1.tif:QTL定位图谱
- SupplementaryFigureS2.tif:标记连锁图
- SupplementaryFigureS3.tif:表型数据分布图
数据格式说明
- 表格数据:XLSX/CSV格式,包含结构化的实验数据和分析结果
- 图像数据:TIF格式,包含实验结果的可视化图表
- 基因注释:CSV格式,包含qSulf-1区间的详细基因注释信息
数据质量说明
- 数据完整性:包含从QTL定位到标记验证的完整研究链条数据
- 准确性:经过实验验证的KASP标记数据,可直接用于育种实践
- 一致性:采用标准的基因注释格式和表型数据记录规范
使用建议
- 优先使用XLSX表格数据进行QTL分析和标记筛选
- 结合CSV注释数据解析qSulf-1区间的候选基因
- 参考TIF图像理解实验结果的可视化呈现
- 建议使用Excel、R或Python进行数据处理和分析
引用格式
建议引用原始论文:"QTL mapping and marker development for tolerance to sulfur phytotoxicity in melon (Cucumis Melo)"
注意事项
- 本数据仅适用于甜瓜硫素耐受性相关研究
- 使用前请确认数据版本与研究需求的匹配性
- 商业用途需联系原始作者获取授权