SulfurPhytotoxicity_Melon_Based甜瓜硫素耐受性QTL定位与KASP标记开发数据

数据集概述

本数据集围绕甜瓜硫素 phytotoxicity 耐受性展开,包含基于重组自交系群体的QTL定位结果、KASP分子标记开发数据及相关验证信息,涉及1个主效QTL(qSulf-1)和2个微效QTL,可支持甜瓜抗硫素 phytotoxicity 育种的分子标记辅助选择。

文件详解

  • 数据文件组
  • 文件名称:SupplementaryTableS1.xlsx、SupplementaryTableS2.xlsx、SupplementaryTableS3.xlsx、SupplementaryTableS4.xlsx、SupplementaryTableS5.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含QTL定位结果、RIL群体表型数据、KASP标记开发信息、标记验证结果等表格数据
  • 文件名称:sulfQ1_annovar.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:包含Chr(染色体)、Start/End(位置)、Ref/Alt(碱基)、Func.refGene(功能注释)、Gene.refGene(基因名称)等qSulf-1区间的基因注释信息
  • 栅格文件组
  • 文件名称:SupplementaryFigureS1.tif、SupplementaryFigureS2.tif、SupplementaryFigureS3.tif
  • 文件格式:TIF
  • 字段映射介绍:包含QTL定位图谱、标记连锁图、表型数据分布等可视化结果

数据来源

论文“QTL mapping and marker development for tolerance to sulfur phytotoxicity in melon (Cucumis Melo)”

适用场景

  • 甜瓜抗逆性育种:用于分子标记辅助选择硫素耐受性甜瓜品种
  • 植物生理学研究:分析硫素 phytotoxicity 对甜瓜叶片损伤的遗传机制
  • 分子遗传学研究:解析qSulf-1等QTL区间的候选基因功能
  • 农业生产应用:指导甜瓜种植中的硫素 fungicide 合理使用

数据文件清单

  • SupplementaryTableS1.xlsx:QTL定位结果表
  • SupplementaryTableS2.xlsx:RIL群体表型数据表
  • SupplementaryTableS3.xlsx:KASP标记开发信息表
  • SupplementaryTableS4.xlsx:标记验证结果表
  • SupplementaryTableS5.xlsx:QTL区间候选基因表
  • sulfQ1_annovar.csv:qSulf-1区间基因注释数据
  • SupplementaryFigureS1.tif:QTL定位图谱
  • SupplementaryFigureS2.tif:标记连锁图
  • SupplementaryFigureS3.tif:表型数据分布图

数据格式说明

  • 表格数据:XLSX/CSV格式,包含结构化的实验数据和分析结果
  • 图像数据:TIF格式,包含实验结果的可视化图表
  • 基因注释:CSV格式,包含qSulf-1区间的详细基因注释信息

数据质量说明

  • 数据完整性:包含从QTL定位到标记验证的完整研究链条数据
  • 准确性:经过实验验证的KASP标记数据,可直接用于育种实践
  • 一致性:采用标准的基因注释格式和表型数据记录规范

使用建议

  • 优先使用XLSX表格数据进行QTL分析和标记筛选
  • 结合CSV注释数据解析qSulf-1区间的候选基因
  • 参考TIF图像理解实验结果的可视化呈现
  • 建议使用Excel、R或Python进行数据处理和分析

引用格式

建议引用原始论文:"QTL mapping and marker development for tolerance to sulfur phytotoxicity in melon (Cucumis Melo)"

注意事项

  • 本数据仅适用于甜瓜硫素耐受性相关研究
  • 使用前请确认数据版本与研究需求的匹配性
  • 商业用途需联系原始作者获取授权
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 2.19 MiB
最后更新 2025年12月30日
创建于 2025年12月30日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。