数据集概述
本数据集围绕南美乌拉圭河流域梭鲈丽鱼(Crenicichla)的系统基因组学研究,包含33个物种的基因组数据、系统发育分析结果及生态分化评估数据,揭示该类群快速演化与营养多样化特征,为物种形成机制研究提供支持。
文件详解
- 图表文件:
- FIG_S1_existing_hypotheses.pdf:PDF格式,现有系统发育假说示意图
- FIG_S2_LM.png:PNG格式,形态学相关图表
- FIG_S3_ML.pdf:PDF格式,最大似然法分析结果图
- FIG_S4_BI.pdf:PDF格式,贝叶斯推断分析结果图
- FIG_S5_SVD.pdf:PDF格式,奇异值分解分析结果图
- 序列数据文件:
- crenicichla_min50_concatenated.phylip:PHYLIP格式,最小50%位点串联序列
- crenicichla_min80_concatenated.phylip:PHYLIP格式,最小80%位点串联序列
- crenicichla_min95_concatenated.phylip:PHYLIP格式,最小95%位点串联序列
- crenicichla_min100_concatenated.phylip:PHYLIP格式,最小100%位点串联序列
- 压缩文件:
- crenicichla_min50_loci.zip:ZIP格式,最小50%位点的基因组位点数据压缩包
- crenicichla_min80_loci.zip:ZIP格式,最小80%位点的基因组位点数据压缩包
- crenicichla_min95_loci.zip:ZIP格式,最小95%位点的基因组位点数据压缩包
- crenicichla_min100_loci.zip:ZIP格式,最小100%位点的基因组位点数据压缩包
- 补充材料:
- Supplementary_Materials_tables_and_Figure_legends.docx:DOCX格式,包含补充表格及图表说明
适用场景
- 进化生物学研究:分析梭鲈丽鱼物种形成机制与快速演化过程
- 生态基因组学研究:探究营养生态位分化与基因组适应性进化的关联
- 系统发育分析:构建梭鲈丽鱼属物种间的系统发育关系
- 形态学与功能性状研究:评估形态特征(如咽颌形状)与食性的相关性
- 生物多样性保护:为乌拉圭河流域特有鱼类群落的保护策略提供科学依据