数据集概述
本数据集为甲虫肠道微生物组16S rRNA分类工具性能分析的补充数据,包含样本信息、分析流程、数学方程及工具分类结果四部分内容,涉及QIIME 2、Mothur、VSEARCH三种工具的性能评估,可支持微生物组分类工具的对比研究,总计包含3个文件。
文件详解
- 文件名称:Supplementary Figure S2 - Supplementaty Equations S3.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含图形化命令行分析流程(Figure S2)及分类工具性能计算的数学方程(Equations S3,不含阴性预测值公式)
- 文件名称:Supplementary Table S1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录甲虫肠道微生物组分析所用样本的登录号及元数据
- 文件名称:Supplementary Table S4.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含QIIME 2、Mothur、VSEARCH三种工具的ASV及分类结果数据,标注是否与Magura et al. (2024)的结果匹配
适用场景
- 微生物组分类工具评估:对比QIIME 2、Mothur、VSEARCH在甲虫肠道微生物组数据中的分类性能
- 微生物组分析流程优化:参考图形化命令行流程设计标准化的16S rRNA分类分析 pipeline
- 微生物组数据标准化研究:利用样本元数据及分类结果数据,探索甲虫肠道微生物组数据的标准化处理方法
- 生物信息学方法验证:基于数学方程复现分类工具性能计算过程,验证评估方法的科学性