数据集概述
本数据集为甘蔗促生细菌群落基因组特征研究的补充信息，包含8个附录文件，覆盖PacBio测序数据统计、宏基因组组装基因组（MAGs）分类、KEGG功能注释、次生代谢物基因簇及促生性状（PGPTs）分析等内容，支持甘蔗相关促生细菌的基因组学研究。
文件详解
- Appendix A：PacBio SMRT文库测序的子读长和CCS序列计数摘要，文件名称EMS_1.xlsx，格式XLSX
- Appendix B：基于GTDB-tk和Kraken工具的MAGs高等级分类注释结果，文件名称EMS_2.xlsx，格式XLSX
- Appendix C：GTDB-tk分类流程报告，文件名称EMS_3.xlsx，格式XLSX
- Appendix D：EnrichM工具注释的KEGG Orthology（KOs）频率矩阵，文件名称EMS_4.xlsx，格式XLSX
- Appendix E：EnrichM注释的KEGG模块重构与完整性结果（含PGPTs估算补充值），文件名称EMS_5.xlsx，格式XLSX
- Appendix F：AntiSMASH识别的次生代谢物生物合成基因簇（BGCs）数据，文件名称EMS_6.xlsx，格式XLSX
- Appendix G：基于KO预测的MAGs植物促生性状（PGPTs）注释原始计数，文件名称EMS_7.xlsx，格式XLSX
- Appendix H：Pearson卡方检验富集的39类PGPTs原始计数（qvalue≤0.1），文件名称EMS_8.xlsx，格式XLSX
适用场景
- 农业微生物基因组学研究：分析甘蔗促生细菌群落的基因组特征与功能潜力
- 微生物分类学分析：基于GTDB-tk和Kraken结果研究MAGs的分类地位
- 功能基因注释研究：利用KEGG Orthology和模块数据解析细菌代谢通路
- 促生性状机制探索：通过PGPTs注释数据研究细菌促进植物生长的分子机制
- 次生代谢物挖掘：基于BGCs数据筛选甘蔗促生细菌的次生代谢产物合成潜力
- 生物信息学方法验证：评估EnrichM、AntiSMASH等工具在微生物组分析中的应用效果
