数据集概述
本数据集为肾脏缺血再灌注损伤（IRI）相关研究的补充表格集合，包含基因表达计数、主题建模结果、细胞亚型标记基因列表、基因本体（GO）富集分析结果及可变剪接外显子信息等10个表格，覆盖肾脏IRI后的细胞状态变化与分子调控机制相关数据。
文件详解
- Table S1 - Counts matrix.Ver-3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：Liu等人RNAseq数据集的基因表达计数及元数据
- Table S2 - Topics Factors and Loadings.xlsx
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- 字段映射介绍：主题建模发现的“因子”及各时间点的“载荷”比例
- Table S3 - Marker Genes.Ver-4.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：文献中健康与损伤肾脏细胞亚型及细胞状态的标记基因列表
- Table S4 - [未提供样本名称]
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：k1主题中过表达基因的GO富集分析结果
- Table S5 - [未提供样本名称]
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：k2主题中过表达基因的GO富集分析结果
- Table S6 - Topic k3 GO analysis.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：k3主题中过表达基因的GO富集分析结果
- Table S7 - Topic k4 GO analysis.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：k4主题中过表达基因的GO富集分析结果
- Table S8 - Topic k5 GO analysis.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：k5主题中过表达基因的GO富集分析结果
- Table S9 - Cassette exons and GO enrichment.Ver-3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：IRI后显著可变剪接的盒式外显子列表、包含水平及GO富集分析结果（FDR=0）
- Table S10 - RNA binding proteins.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：本研究中检测的已知RNA结合蛋白及基序列表
适用场景
- 肾脏损伤分子机制研究: 分析缺血再灌注损伤后肾脏细胞状态变化与基因表达调控规律
- 可变剪接功能分析: 探究IRI诱导的盒式外显子可变剪接事件及其生物学意义
- 基因本体富集分析: 解析不同主题模块中过表达基因的功能聚类与通路关联
- 细胞亚型标记基因验证: 参考健康与损伤肾脏的细胞亚型标记基因列表开展实验设计
- RNA结合蛋白调控研究: 基于已知RNA结合蛋白及基序数据，探索其在肾脏IRI中的作用机制
