数据集概述
本数据集包含甲酰胺(H2NCHO)部分脱氢自由基与丙烯腈(H2CCHCN)反应生成1H-嘧啶-2-酮(C4H4N2O)过程中,反应物(RC)、中间体(IM)、过渡态(TS)和产物(PD)的优化原子构型数据,以及相关反应的速率系数文件。数据通过密度泛函理论计算得到。
文件详解
- 压缩包文件:
- 文件名称:SuppMater.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:包含/datafile文件夹和RateCoefficient.pdf。/datafile内的.data文件命名规则为“反应ID_分子状态名”(如C4-TS2.data),记录反应各阶段分子的原子数、吉布斯自由能(100K热自由能校正,单位a.u.)、原子类型及笛卡尔坐标;以Cytosine、Uracil、Thymine开头的文件对应1H-嘧啶-2-酮与氨基、甲基或羟基反应的构型数据。RateCoefficient.pdf记录最有利反应路径的速率系数随温度变化的数据。
适用场景
- 化学反应机理研究: 分析甲酰胺与丙烯腈自由基反应生成1H-嘧啶-2-酮的路径、过渡态结构及能量变化。
- 分子构型计算验证: 基于密度泛函理论计算结果,验证反应各阶段分子的优化构型合理性。
- 反应动力学分析: 利用速率系数文件研究温度对反应速率的影响,优化反应条件。
- 嘧啶类衍生物合成研究: 探索1H-嘧啶-2-酮生成胞嘧啶、胸腺嘧啶、尿嘧啶的反应构型与机制。