数据集概述
本数据集为Polydectinae蟹类海葵携带行为进化起源研究的支撑数据,包含线粒体基因组序列、基因注释及相关序列比对文件。通过分析19种蟹类的线粒体基因组,结合系统发育重建与化石校准,探究该行为的起源时间与进化历程,结果显示其起源于始新世晚期,存在三个深度进化支系。
文件详解
- README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据来源、组装与注释方法、序列比对数据集的分类深度与序列数量差异等信息。
- Polydectinae_3genes.fsa.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:Polydectinae蟹类3个基因的序列比对文件,包含从线粒体基因组中提取的蛋白编码基因序列及GenBank公开序列。
- annotations.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:线粒体基因组注释文件压缩包,包含经MITOS2注释并手动校正的基因注释信息。
- Xanthidae_mtGenome.fsa.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:Xanthidae科蟹类的线粒体基因组序列文件。
- Polydectinae_COI.fsa.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:Polydectinae蟹类COI基因的序列比对文件。
数据来源
论文“Supporting data: Eocene origin of anemone carrying in polydectine crabs”
适用场景
- 生物进化研究: 分析Polydectinae蟹类海葵携带行为的起源时间与进化支系。
- 线粒体基因组学分析: 利用完整线粒体基因组序列开展系统发育重建与基因功能研究。
- 海洋无脊椎动物行为进化研究: 探究海洋无脊椎动物特殊防御行为的进化机制。
- 生物多样性研究: 基于基因序列比对分析Polydectinae蟹类的分类学深度与物种多样性。