数据集概述
本数据集是论文“Competitiveness of Planctomycetes inhabiting macroalgae phycosphere in coastal ocean: evidences from a representative isolate with strong ability to degrade fucoidan”的补充信息，包含菌株HD01的基因预测、系统发育分析、生理特性及岩藻多糖降解相关数据，共12个文件，支持浮游菌在海藻附生圈竞争力的研究。
文件详解
- 系统发育分析文件
- 文件名称：16S rRNA.mtsx、MLST.mtsx
- 文件格式：MTSX
- 字段映射介绍：用于生成论文补充图1，包含16S rRNA基因及多位点序列分型（MLST）的相关数据
- 基因预测文件
- 文件名称：HD01.faa、HD01.gbk、HD01.gff
- 文件格式：FAA、GBK、GFF
- 字段映射介绍：由Prokka生成的菌株HD01基因预测结果，包含氨基酸序列（FAA）、基因组注释（GBK）及基因特征格式（GFF）数据
- 岩藻多糖降解相关文件
- 文件名称：sulfatase_HD01.blast
- 文件格式：BLAST
- 字段映射介绍：使用SulfAtlas分析菌株HD01基因组中硫酸酯酶的结果数据
- 生理特性原始数据文件
- 文件名称：Temperature_NaCl_pH.xlsx、carbon_nitrogen_source.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：菌株HD01在不同温度、盐度、pH条件及碳氮源下的生理特性原始数据
- 数据集文件
- 文件名称：dataset1.tsv、dataset2.annotations、dataset3.xlsx
- 文件格式：TSV、ANNOTATIONS、XLSX
- 字段映射介绍：论文研究用核心数据集，包含基因座标签、基因类型、长度、EC编号、COG功能注释等信息（dataset1.tsv示例字段：locus_tag、ftype、length_bp、gene、EC_number、COG、product）
- 元数据说明文件
- 文件名称：Metadata-LO-Letters-data_Gao et al_1..docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：dataset1-3的描述性元数据
数据来源
高团队（Gao et al.）论文“Competitiveness of Planctomycetes inhabiting macroalgae phycosphere in coastal ocean: evidences from a representative isolate with strong ability to degrade fucoidan”
适用场景
- 海洋微生物生态研究：分析浮游菌在海藻附生圈的生存竞争力及生态位特征
- 微生物降解机制研究：探究菌株HD01降解岩藻多糖的分子机制及相关功能基因
- 微生物生理特性分析：研究温度、盐度、pH及碳氮源对浮游菌生长的影响
- 海洋微生物组学研究：支持海藻附生微生物群落结构与功能的关联分析
- 生物技术应用开发：为岩藻多糖降解酶的筛选及海洋微生物资源利用提供数据支持
