宿主_寄生虫祖先互作的贝叶斯推断数据集

数据集概述

本数据集围绕宿主-寄生虫共进化历史的贝叶斯推断方法展开,包含模型模拟代码、系统发育数据文件及补充文档,支持研究宿主范围演化的复杂性(如宿主的获得与丢失),并应用于34种蛱蝶与25个被子植物科的互作历史分析。

文件详解

  • 代码文件:
  • Rscript_simulation.R、Rscript_empirical.R: R语言脚本,用于模拟与实证分析
  • Simulate.Rev、Infer_simulation.Rev、Infer_empirical.Rev: RevBayes程序脚本,实现模型模拟与推断
  • 系统发育数据文件:
  • nymphalini.3s.nex、nymphalini.2s.nex: Nexus格式文件,可能为蛱蝶系统发育数据
  • angio_25tips_origin.phy、angio_25tips_bl1.phy、Nymphalini.phy: Phylip格式文件,包含被子植物与蛱蝶的系统发育树
  • 补充文档:
  • Supplementary.pdf: PDF格式,提供研究方法或结果的补充说明

适用场景

  • 进化生物学研究: 分析宿主-寄生虫共进化历史中的宿主范围演化机制
  • 统计模型验证: 测试贝叶斯推断方法在处理复杂宿主范围数据时的性能
  • 生物互作分析: 探究宿主亲缘关系对寄生虫宿主获得过程的影响
  • 计算生物学应用: 利用RevBayes与R脚本复现或扩展共进化历史推断分析
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.51 MiB
最后更新 2025年12月23日
创建于 2025年12月23日
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