数据集概述
本数据集包含与"宿主水平生物多样性塑造珊瑚礁微生物组动态与网络"相关的研究数据,涵盖珊瑚礁微生物组的ASV表、元数据、分类学注释、多样性指数及KEGG通路映射等文件,用于支持相关研究论文的图表生成。
文件详解
- raw_host-associated_1.asvs.tsv:TSV格式,宿主关联样本的ASV表
- raw_host-associated_2.asvs.tsv:TSV格式,宿主关联样本的ASV表
- raw_free-living_1.asvs.tsv:TSV格式,Sterivex样本的ASV表
- raw_free-living_2.asvs.tsv:TSV格式,Sterivex样本的ASV表
- metadata_host-associated.csv:CSV格式,宿主关联样本的元数据
- metadata_free-living.csv:CSV格式,Sterivex样本的ASV表
- asv_dat_taxinfo.tsv:TSV格式,使用SILVA v138.1注释的分类学信息
- asv_bctab.tsv:TSV格式,平方根转换的Bray-Curtis相异度数据
- asv_richtab.tsv:TSV格式,Hill数多样性指数
- asv_shared.tsv:TSV格式,共享ASV数量
- pathway_list_cat.csv:CSV格式,含手动注释类别的KEGG通路列表
- KEGG_path_to_ko.tsv:TSV格式,KEGG通路与KO映射文件
适用场景
- 珊瑚礁生态学研究:分析宿主生物多样性对微生物组结构的影响
- 微生物组网络分析:探究珊瑚礁微生物间的相互作用模式
- 生物信息学分析:开展微生物分类学注释及多样性指数计算
- 功能基因组学研究:解析珊瑚礁微生物的KEGG通路功能特征
- 海洋环境科学:研究珊瑚礁生态系统中宿主-微生物的关联机制