数据集概述
本数据集围绕深海贻贝与管虫共生菌特异性展开研究,分析哥斯达黎加西海岸甲烷渗漏区3种贻贝和3种管虫的共生菌多样性,对比宿主身份与地理位置对共生菌选择的影响,提供共生菌身份检测的快速方法,包含4份相关文件。
文件详解
- readme.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集标题、研究者信息、数据收集日期及许可说明等基础信息
- Direct_ITS_Sequence_alignment.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录直接ITS序列比对数据,包含样本ID(如Bearlougheri_012_M12_ITS)及对应的ITS基因序列信息
- ITS_barcodes_with_representatives.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:存储带有代表性样本的ITS条形码数据,用于识别共生菌多样性
- 16S_Sequence_alignment.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含16S rRNA基因序列比对数据,用于分析共生菌的系统发育关系
数据来源
Occidental College(研究者Shana Goffredi团队)
适用场景
- 深海共生菌特异性机制研究:对比分析宿主身份与地理位置对贻贝、管虫共生菌选择的影响差异
- 海洋无脊椎动物共生关系分析:探究深海贻贝与管虫共生菌的多样性及共生模式
- 共生菌分子鉴定方法优化:验证通过ITS和16S序列分析检测共生菌身份的快速精确方法
- 深海生态系统共生网络构建:基于共生菌特异性数据构建深海生物共生关系网络模型