数据集概述
本数据集包含热带树种Symphonia globulifera的基因组工具开发成果，包括首个低覆盖度（11X）基因组草图、单核苷酸多态性（SNP）及简单序列重复（SSR）标记数据。数据覆盖该树种67.5%的预估基因组大小，含基因注释、SSR标记及跨地理种群的遗传多态性信息，可支持种群遗传学及比较基因组学研究。
文件详解
- 文档文件（TXT格式）
- 文件名称：README_for_Sglo18+morphotypes.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含Sglo18+morphotypes相关数据的说明文档
- 文件名称：README_for_symph_genome.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明基因组数据的组装方法（Illumina及454测序文库）、数据内容及SymphoniaDB数据库链接
- 文件名称：Sglo18+morphotypes.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含ID、Place等字段的形态类型及相关数值数据
- 归档文件（ZIP格式）
- 文件名称：symph_genome.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含Symphonia globulifera的基因组草图数据，含组装的contigs、scaffolds及基因注释信息
数据来源
论文“Development of genomic tools in a widespread tropical tree, Symphonia globulifera L.f.: a new low-coverage draft genome, SNP and SSR markers”
适用场景
- 热带树种种群遗传学研究：分析Symphonia globulifera跨非洲及新热带区种群的遗传结构与多样性
- 基因组工具开发验证：评估低覆盖度基因组草图在遗传标记开发中的应用效果
- 比较基因组学分析：为热带植物类群的基因组进化研究提供参考数据
- 濒危物种保护遗传学：支持利用SSR标记开展珍稀热带树种的种群遗传监测
- 分子标记辅助育种：筛选适用于Symphonia globulifera遗传多样性分析的SSR标记位点
