数据集概述
本数据集为《DNA barcodes and microsatellites: how they complement for species identification in the complex genus Tamarix (Tamaricaceae)》一文的补充数据,包含5种DNA条形码标记(rbcL、matK、ITS、trnH-psbA、ycf1)和14个微卫星标记的相关数据,用于测试两种标记在柽柳属物种鉴定中的能力,尤其是地中海地区物种,共含5个文件。
文件详解
- 文件名称:README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,介绍数据背景、来源及各文件内容概述
- 文件名称:Sequences_fasta_matrices.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含DNA条形码序列的FASTA格式矩阵文件,涉及rbcL、matK、ITS、trnH-psbA、ycf1五种标记区域的序列数据
- 文件名称:BTAM_BOLD_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:BOLD项目“Barcoding of the genus Tamarix”(BTAM)的样本数据表格,包含样本的基础信息及条形码数据关联信息
- 文件名称:Microsatellite_data.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含14个微卫星标记的原始数据及分析相关文件,用于柽柳属物种的微卫星标记鉴定分析
- 文件名称:Sequences_trace_files.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含DNA条形码序列的原始测序trace文件,记录序列测定的原始信号数据
数据来源
论文“DNA barcodes and microsatellites: how they complement for species identification in the complex genus Tamarix (Tamaricaceae)”(发表于Journal of Systematics and Evolution)
适用场景
- 植物分类学研究: 用于柽柳属复杂物种的遗传鉴定,解决形态趋同导致的分类误差问题
- 遗传标记性能评估: 对比DNA条形码(单标记及组合)与微卫星标记在物种鉴定中的准确率及适用范围
- 地中海植物区系研究: 针对地中海地区柽柳属物种的系统发育关系及物种区分分析
- 杂交物种检测: 结合DNA条形码与微卫星数据,识别柽柳属中常见的杂交过程
- 分子生态学分析: 利用微卫星标记数据研究物种的种群遗传结构与遗传多样性