Tamarix_Based_柽柳属DNA条形码与微卫星物种鉴定补充数据

数据集概述

本数据集为《DNA barcodes and microsatellites: how they complement for species identification in the complex genus Tamarix (Tamaricaceae)》一文的补充数据,包含5种DNA条形码标记(rbcL、matK、ITS、trnH-psbA、ycf1)和14个微卫星标记的相关数据,用于测试两种标记在柽柳属物种鉴定中的能力,尤其是地中海地区物种,共含5个文件。

文件详解

  • 文件名称:README.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:数据集说明文档,介绍数据背景、来源及各文件内容概述
  • 文件名称:Sequences_fasta_matrices.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:包含DNA条形码序列的FASTA格式矩阵文件,涉及rbcL、matK、ITS、trnH-psbA、ycf1五种标记区域的序列数据
  • 文件名称:BTAM_BOLD_data.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:BOLD项目“Barcoding of the genus Tamarix”(BTAM)的样本数据表格,包含样本的基础信息及条形码数据关联信息
  • 文件名称:Microsatellite_data.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:包含14个微卫星标记的原始数据及分析相关文件,用于柽柳属物种的微卫星标记鉴定分析
  • 文件名称:Sequences_trace_files.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:包含DNA条形码序列的原始测序trace文件,记录序列测定的原始信号数据

数据来源

论文“DNA barcodes and microsatellites: how they complement for species identification in the complex genus Tamarix (Tamaricaceae)”(发表于Journal of Systematics and Evolution)

适用场景

  • 植物分类学研究: 用于柽柳属复杂物种的遗传鉴定,解决形态趋同导致的分类误差问题
  • 遗传标记性能评估: 对比DNA条形码(单标记及组合)与微卫星标记在物种鉴定中的准确率及适用范围
  • 地中海植物区系研究: 针对地中海地区柽柳属物种的系统发育关系及物种区分分析
  • 杂交物种检测: 结合DNA条形码与微卫星数据,识别柽柳属中常见的杂交过程
  • 分子生态学分析: 利用微卫星标记数据研究物种的种群遗传结构与遗传多样性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 69.14 MiB
最后更新 2026年1月26日
创建于 2026年1月26日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。