数据集概述
本数据集为Arabidopsis属非模式谱系基因库解析研究的配套数据，通过ITS、微卫星、叶绿体DNA及核DNA含量等分子标记与细胞学分析，识别出A.lyrata、A.halleri、A.arenosa三大进化群及多个独立谱系，解决了属内亚种与生态型分类混乱问题，为非模式Arabidopsis谱系的进化研究提供基础框架。
文件详解
- Additional_File_1_Alignment_ITS.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含ITS序列比对数据，以FASTA格式存储，每条序列含 accession号（如DQ528814）及核苷酸序列信息，用于物种进化关系分析
- Additional_File_2_Alignment_trnLF.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含叶绿体trnLF区域序列比对数据，FASTA格式存储，用于叶绿体基因组遗传变异分析
- Additional_File_5_Accessiontable_genomesizesFINAL.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含样本accession信息与核DNA含量数据（通过流式细胞术测定），用于基因库遗传分化分析
- Additional_File_6_Microsatellites.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含微卫星标记数据，用于种群遗传结构与基因流分析
数据来源
论文“Taming the wild: resolving the gene pools of non-model Arabidopsis lineages”
适用场景
- 植物进化生物学研究: 分析Arabidopsis属非模式谱系的进化关系与基因库分化
- 分子系统学分析: 利用ITS、叶绿体序列数据构建物种系统发育树
- 种群遗传学研究: 通过微卫星标记探究种群遗传多样性与结构
- 基因组学研究: 结合核DNA含量数据解析物种基因组进化特征
- 植物分类学应用: 辅助Arabidopsis属内亚种与生态型的分类修订
