数据集概述
本数据集包含桃蚜（Myzus persicae）唾液蛋白质组的高质量数据，通过纳米液相色谱-串联质谱（nanoLC-MS/MS）分析结合更新的基因组注释生成。数据来自约一万头桃蚜的唾液样本，涵盖肽段鉴定、蛋白质分组及基因模型关联等信息，为研究植物-昆虫互作分子机制提供支持。
文件详解
- 核心数据文件：
- 质谱原始数据：已存入ProteomeXchange Consortium的PRIDE数据库，数据集标识符PXD055051
- 肽段列表文件（Table 1）：包含Mascot和CHIMERYS搜索引擎检测到的所有肽段信息
- 蛋白质列表文件（Table 2）：包含检测到的蛋白质分组、主蛋白质及丰度数据
- 基因模型注释文件（Table 3）：包含编码唾液蛋白质的219个基因模型及功能注释
- 基因组注释文件：
- Myzus_persicae_O_v2.0.scaffolds.fa：桃蚜基因组 scaffold 序列
- CloneO_v2.1_annotation_summary_stats.txt：基因组注释统计摘要
- MYZPE13164_O_EIv2.1.annotation.gff3：GFF3格式基因组注释文件
- MYZPE13164_O_EIv2.1.annotation.gff3.pep.fasta：蛋白质序列数据库
- Myzus_persicae_O_annotation_readme.doc：注释说明文档
数据来源
ProteomeXchange Consortium（PRIDE数据库）
适用场景
- 植物保护研究：分析桃蚜唾液蛋白对植物防御的抑制机制
- 分子昆虫学研究：探究桃蚜适应宿主植物的分子基础
- 蛋白质组学方法学：验证nanoLC-MS/MS在昆虫唾液蛋白检测中的应用
- 农业生物技术：开发针对桃蚜唾液效应蛋白的靶向防控技术
