数据集概述
本数据集为玻利维亚克氏锥虫TcI生态宿主适应研究的支撑数据,包含199个同期野生TcI克隆的高分辨率核基因(26个位点)和线粒体基因(10个位点)分型结果,识别出3种不同的野生寄生虫传播周期,分析了基因流、交配策略差异及人类活动对寄生虫扩散的影响,共含6个相关文件。
文件详解
- 系统发育文件(无扩展名)
- 文件名称:Microsatellite neighbour-joining phylogeny、Mitochondrial maximum-likelihood phylogeny
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:分别为微卫星邻接系统发育树、线粒体最大似然系统发育树,用于展示寄生虫的遗传进化关系
- 补充文件S1
- 文件名称:Supplementary File S1 T cruzi microsatellite alleles at 26 loci.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含克氏锥虫在26个微卫星位点的等位基因数据
- 表格文件
- 文件名称:Table_S1_Panel_of_Bolivian_T_cruzi_TcI_biological_clones.docx、Table_S2_Panel_of_microsatellite_loci_and_primers.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:分别为玻利维亚克氏锥虫TcI生物克隆面板、微卫星位点与引物面板
- 序列比对文件
- 文件名称:Concatenated maxicircle sequence alignment.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:线粒体大环序列的拼接比对数据
数据来源
论文“Ecological host fitting of Trypanosoma cruzi TcI in Bolivia: mosaic population structure, hybridization and a role for humans in Andean parasite dispersal”
适用场景
- 寄生虫遗传多样性研究:分析克氏锥虫TcI在玻利维亚不同生态区的种群结构与遗传分化
- 宿主适应机制分析:探究寄生虫对不同宿主(陆生啮齿动物、树栖哺乳动物)的生态适应策略
- 基因流与传播研究:评估不同地理区域、生态环境间的寄生虫基因交流强度
- 人类活动影响评估:研究人类活动对克氏锥虫扩散及恰加斯病传播风险的影响
- 分子分型方法应用:验证微卫星和线粒体基因分型在寄生虫研究中的有效性