数据集概述
本数据集为弹性蛋白酶诱导小鼠腹主动脉瘤模型中T、B细胞克隆性研究的TCR/BCR测序数据，包含造模后3、7、14、28天及假手术、未手术对照组小鼠肾下腹主动脉淋巴细胞的单细胞测序结果，提供CellRanger输出文件、哈希抗体与TCR/BCR及样本对应信息，共71个文件，用于分析T/B细胞克隆性特征。
文件详解
- 样本与哈希信息文件
- 文件名称：Information about Hashtags and Samples.xlsx、Hashtag_cellIDs_401_1.csv
- 文件格式：XLSX、CSV
- 字段映射介绍：记录哈希抗体（HTO）与细胞ID、样本的对应关系，包含HTO_maxID、Cell_Id等字段
- 细胞克隆型文件
- 文件名称：401-1_vdjt_clonotypes.csv、401-3_vdjt_clonotypes.csv、401-3_vdjb_clonotypes.csv等
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：存储T、B细胞的克隆型信息
- 测序结果文件
- 文件名称：401-1_vdjt_filtered_contig.fastq、401-3_vdjb_filtered_contig.fasta等
- 文件格式：FASTQ、FASTA、BAM、BAI等
- 字段映射介绍：包含过滤后的序列、参考序列比对结果及索引文件
- 分析结果文件
- 文件名称：401-1_vdjt_airr_rearrangement.tsv、401-1_vdjt_vloupe.vloupe等
- 文件格式：TSV、VLOUPE、JSON等
- 字段映射介绍：存储AIRR标准重排数据、可视化文件及细胞条形码信息
- 其他数据文件
- 文件名称：401-1_vdjt_vdj_contig_info.pb等
- 文件格式：PB
- 字段映射介绍：包含VDJ contig信息的二进制文件
数据来源
论文“Application and challenges of TCR and BCR sequencing to investigate T- and B-cell clonality in elastase-induced experimental murine abdominal aortic aneurysm”
适用场景
- 腹主动脉瘤免疫机制研究: 分析T、B细胞克隆性在动脉瘤发生发展中的作用
- 免疫测序技术应用评估: 探究TCR/BCR测序技术在小鼠模型免疫研究中的应用价值与挑战
- 淋巴细胞克隆演化分析: 研究不同时间点动脉瘤组织中T、B细胞克隆的动态变化
- 免疫细胞分型研究: 结合单细胞测序数据解析动脉瘤相关免疫细胞的亚型特征
- 疾病模型免疫应答研究: 为弹性蛋白酶诱导腹主动脉瘤模型的免疫应答机制提供数据支持
