数据集概述
本数据集为论文《Exhaustion-resistant T cell clones form functional memory after chronic infection and immunotherapy》关联的批量T细胞受体测序（TCR-seq）数据，包含四组实验数据，涉及慢性病毒感染及免疫治疗中抗衰竭T细胞克隆的分化模式与记忆形成能力，支持T细胞功能及免疫治疗响应机制研究。
文件详解
- 样本信息文件
- 文件名称：TCR-seq Samples.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含数据集、样本名称、计算总细胞数、生物、器官、TCR-seq模式、重复文件名称等字段，记录各样本的基础信息与测序关联文件
- 实验(1)相关TSV文件
- 文件名称：遵循TCRgp33_Processed_bulkTCRseq_.tsv、TCRgp276_Processed_bulkTCRseq_.tsv模式
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：记录LCMV-Cl13感染100+天GP33+、GP276+ T细胞亚群的基因组DNA TCR-seq数据
- 实验(2)相关TSV文件
- 文件名称：遵循TCRspleenblood_Processed_*.tsv模式
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：记录LCMV-Cl13感染28天血液及脾脏PD1+衰竭T细胞亚群的基因组DNA TCR-seq数据
- 实验(3)相关CSV文件
- 文件名称：遵循TCRrechalenge_Processed_*.csv模式
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：记录LCMV-Cl13或Arm感染100+天、再激发前CD8+ T细胞亚群的RNA TCR-seq数据（含重复样本）
- 实验(4)相关CSV文件
- 文件名称：遵循TCRlongtiduinal_Processed_*.csv模式
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：记录LCMV-Cl13感染21、35、100+天±αPD-L1治疗的CD8+ T细胞亚群纵向RNA TCR-seq数据（含重复样本）
数据来源
论文《Exhaustion-resistant T cell clones form functional memory after chronic infection and immunotherapy》
适用场景
- T细胞分化模式研究: 分析慢性抗原暴露下抗衰竭T细胞克隆的分化轨迹及记忆形成潜力
- 免疫治疗响应机制分析: 探究抗衰竭T细胞克隆对PD-1阻断治疗的响应机制
- 慢性感染免疫记忆研究: 研究慢性病毒感染后T细胞的长期记忆维持与功能恢复
- T细胞受体克隆多样性分析: 基于TCR-seq数据解析不同T细胞亚群的克隆组成与动态变化
