数据集概述
本数据集是研究健康志愿者泪液蛋白质组成正常变异的MS/MS搜索结果,包含34个文件。研究通过定量蛋白质组学方法分析泪液样本的蛋白质谱,评估了标准化和异常值排除方法以减少变异,发现泪液蛋白质组和免疫球蛋白组成具有个人特征,并识别出与蛋白质来源相关的相关蛋白簇。
文件详解
- XML文件(24个)
- 文件名称:如interact-TEAR-POOL-GE-08.pep.xml、combined.prot.xml等
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:interact-( ).pep.xml为混合样本的单个DDA搜索结果(FragPipe);combined.prot.xml为混合样本的合并DDA搜索结果(FragPipe),包含蛋白质鉴定相关信息。
- TSV文件(9个)
- 文件名称:如DIANN-fragiso-quant.tsv、DIANN-fragiso-quant.pr_matrix.tsv等
- 文件格式:TSV
- 字段映射介绍:包含Protein.Group、Protein.Ids、Protein.Names、Genes等蛋白质组学定量信息,以及不同样本(如DIA-D1-OD-1.mzML)的定量数据矩阵。
- TXT文件(1个)
- 文件名称:Data_Files.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含文件描述信息,说明各文件的用途,如interact-( ).pep.xml为混合样本的单个DDA搜索结果等。
适用场景
- 泪液蛋白质组学研究:分析健康人群泪液蛋白质组成的个体差异、日内差异和眼间差异。
- 生物标志物发现:探索泪液中具有个人特征的蛋白质组和免疫球蛋白组成,为疾病诊断潜在生物标志物提供参考。
- 蛋白质组学数据分析方法优化:评估标准化和异常值排除方法在减少泪液蛋白质组数据变异中的效果。
- 蛋白质相互作用研究:通过相关分析识别泪液中与蛋白质来源相关的蛋白簇。