数据集概述
本数据集包含濒危鳉鱼(Eucyclogobius newberryi)种群动态与遗传漂变分析的相关数据,涉及分子遗传数据和实地调查数据的对比分析,用于验证灭绝-定居动态模型,评估种群结构和保护策略。数据集包含8个文件,涵盖遗传距离、栖息地占用历史、位点参考等多类型数据。
文件详解
- 遗传与地理数据文件
- 文件名称:Distance data KM above FST below.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含地理距离(KM)和遗传分化指数(FST)数据,用于分析地理隔离与遗传分化的关系
- 栖息地占用数据文件
- 文件名称:Tidewater Goby Occupancy History Northcoast Haul Data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录北海岸鳉鱼栖息地占用历史数据,包含采样点占用状态和时间序列信息
- 位点参考数据文件
- 文件名称:Site IDs References STRUCTURE.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:提供STRUCTURE分析所用的位点ID参考信息,包含采样位点的标识和分类数据
- 遗传结构分析文件
- 文件名称:outtree.consense.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含种群聚类分析的系统发育树数据,显示不同鳉鱼种群(Pop027-Pop036)的遗传关系和分支支持度
- 基因数据文件
- 文件名称:Goby Combined.genepop.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:GENEPOP格式的联合基因数据,包含多个鳉鱼种群的基因型信息
- 项目数据文件
- 文件名称:project_data
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:项目相关的综合数据文件,具体内容未详细说明
- 种群分析配置文件
- 文件名称:GobyFull.spj
- 文件格式:SPJ
- 字段映射介绍:种群遗传学分析软件(如Structure)的配置文件,包含分析参数设置
数据来源
论文“Temporal genetic analysis of the endangered tidewater goby: metapopulation dynamics or drift in isolation?”
适用场景
- 濒危物种保护研究:分析鳉鱼种群结构和动态,评估灭绝风险和保护策略
- 种群遗传学研究:利用遗传数据探讨种群分化、遗传漂变和基因流模式
- 保护生物学应用:为人工迁移等保护措施提供科学依据,优化濒危物种恢复计划
- 分子生态学分析:对比分子数据与实地调查数据,验证种群动态模型的准确性
- 生物多样性监测:长期监测濒危鳉鱼种群遗传多样性变化,评估保护措施效果