数据集概述
本数据集为日本蚱蜢（Tetrix japonica）的从头转录组测序与分析结果，包含成虫和幼虫样本的转录组数据。通过Illumina HiSeq 2000平台测序，经Trinity组装得到61141条unigenes，其中29225条完成功能注释，并识别出色素通路、保幼激素代谢相关基因及SNP、SSR分子标记，为该物种及其他蚱蜢的基因研究提供资源。
文件详解
- 转录组数据压缩包
- 文件名称：TjA-Unigene.zip、TjL-Unigene.zip、TjATjL-Unigene.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：分别包含日本蚱蜢成虫样本unigenes（TjA-Unigene.fa）、幼虫样本unigenes（TjL-Unigene.fa）、成虫与幼虫合并样本unigenes（TjATjL-Unigene.fa）的序列文件
- 说明文档
- 文件名称：read me.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明各unigene文件的样本对应关系，如"TjA-Unigene.fa"代表成虫样本unigenes，"TjL-Unigene.fa"代表幼虫样本unigenes等
数据来源
论文“Characterization and analysis of a de novo transcriptome from the pygmy grasshopper Tetrix japonica”
适用场景
- 昆虫基因功能研究：分析日本蚱蜢成虫与幼虫的基因表达差异，挖掘色素通路、保幼激素代谢相关功能基因
- 分子标记开发：利用识别出的SNP和SSR位点，开发该物种及近缘蚱蜢的分子标记
- 转录组组装方法验证：基于Illumina测序数据及Trinity组装结果，验证从头转录组组装的效率与准确性
- 蚱蜢科基因组资源补充：为蚱蜢科（Tetrigoidea）昆虫的比较基因组学、进化生物学研究提供基础数据
