数据集概述
本数据集围绕条形码标记的SARS-CoV-2病毒展开，通过仓鼠模型研究暴露持续时间和途径对病毒传播瓶颈的影响。包含下一代测序的fastq文件、条形码计数矩阵及RT-qPCR病毒滴度结果，为病毒传播机制研究提供数据支持。
文件详解
- 主说明文件:
- 文件名称: Master-README.txt
- 文件格式: TXT
- 内容: 数据集的核心说明文档，可能包含实验背景、数据结构、文件组织等关键信息
- 测序数据文件 (位于 Figure_1_S1-S2_fastq_files/ 目录下):
- 文件名称示例: Boon-RT_T47_H03_WL_SIC_index_1031_SIC_Index2_301_GGTGCTGAGA_ATTGCTAGC_S86_R1_001.fastq.gz
- 文件格式: FASTQ.GZ（压缩的高通量测序格式）
- 内容: 包含条形码标记病毒的小扩增子下一代测序原始数据，记录各样本中不同条形码的序列信息
- 未明确列出的关联文件:
- 计数矩阵文件: 可能包含各样本中不同条形码的数量统计数据
- RT-qPCR结果文件: 可能记录不同呼吸组织中的病毒滴度测量数据
适用场景
- 病毒学研究: 分析SARS-CoV-2病毒在仓鼠模型中的传播瓶颈特性
- 传染病学分析: 探究暴露持续时间和途径（空气传播、直接接触、污染物传播）对病毒传播的影响
- 分子生物学研究: 基于条形码标记技术追踪病毒传播路径与演化
- 公共卫生策略制定: 为病毒传播干预措施的有效性评估提供实验数据支持
