萜类合酶检索工具支持数据集

数据集概述

本数据集为萜类合酶(TPS)检索工具的研究提供支持,包含工具开发的引导树文件、验证用的TPS基因数据集、咖啡属及皂皮树属植物的TPS基因识别结果,以及皂皮树转录组组装的肽序列文件。

文件详解

  • 文件名称: PB_all.pdf,文件格式: PDF,内容: TPS特异性HMM模型开发使用的引导树文件
  • 文件名称: CaseStudy1.xlsx,文件格式: XLSX,内容: 工具验证用的拟南芥、番茄、谷子的TPS基因数据集
  • 文件名称: ValidatioTablev1.xlsx,文件格式: XLSX,内容: 咖啡种及皂皮树中识别的TPS基因数据表
  • 文件名称: Trinity_Qsap_pep.fasta,文件格式: FASTA,内容: 皂皮树转录组组装的注释肽序列文件
  • 文件名称: search_TPS_Tutorialvf.pdf,文件格式: PDF,内容: search_TPS工具的使用教程文档

适用场景

  • 生物信息学工具开发研究: 用于萜类合酶检索工具的开发与验证
  • 植物分子生物学研究: 分析咖啡属及皂皮树属植物的TPS基因特征
  • 转录组学研究: 研究皂皮树转录组组装及注释方法
  • 萜类代谢途径研究: 探索植物萜类化合物合成相关基因功能
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 10.79 MiB
最后更新 2025年12月5日
创建于 2025年12月5日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。