数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了EW35品系(携带sem-4基因ga82等位突变)成虫在NGM培养基上的行为实验数据。实验由英国MRC分子生物学实验室完成,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频原始数据、特征提取结果及标准化行为数据文件。
文件详解
- 行为特征数据文件:
- 文件名称:sem-4 (ga82)I on food L_2010_07_22__16_27_56__13_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含25341个分段骨架数据及相关行为特征参数
- 原始追踪数据文件:
- 文件名称:sem-4 (ga82)I on food L_2010_07_22__16_27_56__13.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储原始行为追踪数据,包含实验时长(899秒)、帧率(30.03帧/秒)、像素分辨率(4.56732微米/像素)等基础参数
- 标准化行为数据压缩包:
- 文件名称:sem-4 (ga82)I on food L_2010_07_22__16_27_56__13.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:存储标准化的线虫行为数据,采用wcon格式(线虫行为数据交换标准格式)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析sem-4基因对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 模式生物行为学分析:研究线虫在食物环境中的运动轨迹、速度及行为特征
- 神经生物学实验验证:验证基因突变对线虫神经调控及行为输出的作用机制
- 生物信息学工具测试:用于tierpsy等行为追踪软件的算法优化与性能评估
- 遗传学与行为学关联分析:探索特定基因位点与生物行为表型的关联性