数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)MT1179品系(egl-14(n549)X突变体)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为表现,包含实验条件、视频参数及分析得到的行为特征数据,共3个文件。
文件详解
- 行为特征文件:
egl-14 (n549)X on food L_2010_07_09__12_03_32___6___5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件分析得到的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、身体姿态等量化特征
- 原始分析文件:
egl-14 (n549)X on food L_2010_07_09__12_03_32___6___5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验的基础分析数据,可能包含视频帧的处理信息与原始行为记录
- 压缩行为数据文件:
egl-14 (n549)X on food L_2010_07_09__12_03_32___6___5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon格式(线虫行为数据标准格式)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析egl-14基因对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 行为生物学实验:研究线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为等特征
- 生物信息学分析:利用tierpsy软件输出的特征数据开展线虫行为量化分析
- 实验方法验证:参考Yemini等人的实验方案,验证线虫行为实验的标准化流程