数据集概述
本数据集围绕茄科红花朵的稀有性与“尖端分布”（tippiness）宏观进化机制展开，包含系统发育树构建、性状进化模型拟合、尖端性指标计算等相关文件，覆盖基因序列、控制文件、分析脚本等15个文件，用于探究红花朵性状的起源、丢失及多样化速率等核心问题。
文件详解
- 基因序列文件
- 文件名称：AllGenes_wOutgroup_Mcoccinea_Waxy.nexus、AllGenes_wOutgroup_Mcoccinea_trnLF.nexus、AllGenes_wOutgroup_Mcoccinea_ITS.nexus、AllGenes_wOutgroup_Mcoccinea_matK.nexus等
- 文件格式：NEXUS
- 字段映射介绍：包含茄科物种及外类群的基因序列数据，用于系统发育树构建
- 系统发育分析文件
- 文件名称：BEAST_Solanaceae_Beauti_diffPriors.xml、BEAST_MCC_SolanaceaeTree.tre、BAMM_RedSolanaceae_controlFile.txt等
- 文件格式：XML、TRE、TXT
- 字段映射介绍：BEAST分析配置文件、最大分支可信度树文件、BAMM分析控制文件，用于物种分化速率及性状进化模拟
- 数据分析脚本
- 文件名称：TippyMetricCalculations.R、ASR_Bisse_Red.R、TippyMetrics_functions.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：尖端性指标计算脚本、祖先状态重建脚本、相关功能函数脚本，用于量化红花朵性状的系统发育分布特征
- 说明文件
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含研究背景、文件清单及使用指引
数据来源
论文“Why are red flowers so rare? Testing the macroevolutionary causes of tippiness”
适用场景
- 植物性状进化研究：分析茄科红花朵性状的起源、丢失及系统发育分布模式
- 宏观进化模型验证：利用HiSSE、BAMM等模型拟合结果，探究性状与物种多样化速率的关联
- 系统发育数据分析：基于基因序列文件构建茄科系统发育树，解析物种亲缘关系
- 进化机制探究：验证红花朵性状是否为“进化死胡同”，分析其对物种灭绝与特化速率的影响
