数据集概述
本数据集为利用转录组数据挖掘冠轮动物(环节动物、软体动物等)及曳鳃动物先天免疫相关Toll样受体(TLR)基因的研究数据。TLR基因通过识别微生物感染启动免疫信号通路,数据集包含相关转录组组装文件及说明文档,支持动物先天免疫系统进化研究。
文件详解
- 压缩文件(TLR_files.zip)
- 文件名称:TLR_files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含多种无脊椎动物的转录组组装文件,如Barentsia_gracilis.fa、Glottidia_pyramidata.fa等,文件格式为FA(核酸序列格式),记录各物种转录组序列信息。
- 说明文档(README_for_TLR_files.txt)
- 文件名称:README_for_TLR_files.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据集相关研究背景,对应论文为Halanych, K.M.和Kocot, K.M. 2014年发表于《The Biological Bulletin》的研究,解释数据来源及用途。
数据来源
论文“Halanych, K.M. and Kocot, K.M. 2014. Data from: Repurposed Transcriptomic Data Facilitate Discovery of Innate Immunity Toll-Like Receptor (TLR) Genes Across Lophotrochozoa. The Biological Bulletin 227”
适用场景
- 无脊椎动物先天免疫研究:分析冠轮动物TLR基因分布,探究其先天免疫系统结构与功能。
- 基因进化分析:比较不同类群TLR基因的结构差异,研究动物免疫相关基因的进化规律。
- 转录组数据复用研究:探索转录组数据在非原始研究目的(如免疫基因挖掘)中的应用价值。
- 免疫信号通路研究:基于TLR基因序列,分析无脊椎动物免疫信号通路的启动机制。