数据集概述
本数据集围绕链球菌溶血素S（SLS）的最小细胞溶解单元识别及TOMM毒素家族扩展展开，包含溶血活性评估、基因簇挖掘、序列比对及系统发育分析相关数据，涉及链球菌、疏螺旋体等物种的SLS样毒素研究，共8个文件，支持微生物毒理学结构-活性关系及家族分类研究。
文件详解
- 序列比对文件
- 文件名称：TOMM D Alignment、SLS-Like TOMM D Alignment.txt、BorreliaTOMMAlignment.docx、SLSlikePrecursorAlignment.docx
- 文件格式：无扩展名、TXT、DOCX
- 字段映射介绍：包含链球菌、疏螺旋体等物种的SLS样TOMM毒素前体序列比对信息，记录不同菌株的毒素序列标识（如AIL11847.1Streptococcus_pyogenes）及比对结果
- 系统发育树文件
- 文件名称：TOMM D ML Tree.nwk、SLS-like TOMM D ML Tree.nwk、MLST tree_Doug_subm.nwk
- 文件格式：NWK
- 字段映射介绍：基于最大似然法构建的系统发育树，反映TOMM家族、SLS样TOMM毒素及疏螺旋体MLST分型的进化关系
- 文本数据文件
- 文件名称：MLSABorreliaMLtree.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含疏螺旋体MLSA分型系统发育树相关数据
数据来源
论文“Identification of the Minimal Cytolytic Unit for Streptolysin S and an Expansion of the Toxin Family”
适用场景
- 微生物毒理学研究：分析链球菌溶血素S的结构-活性关系，定义最小细胞溶解单元
- TOMM毒素家族分类：基于序列比对和系统发育树，扩展并分类SLS样TOMM毒素家族
- 病原体毒力因子分析：研究疏螺旋体等物种中SLS样毒素的潜在细胞溶解活性及生物学意义
- 微生物进化分析：通过系统发育树探究TOMM毒素家族及疏螺旋体菌株的进化关系
- 基因组挖掘验证：支持PCR筛选结果与公开基因组序列中SLS样基因簇的 prevalence 对比分析
