铜绿假单胞菌抗菌药物耐药性机器学习预测数据集

数据集概述

本数据集为论文“Predicting antimicrobial resistance in Pseudomonas aeruginosa with machine learning-enabled molecular diagnostics”配套数据,包含铜绿假单胞菌菌株的耐药表型数据及基因表达、基因存在/缺失、单核苷酸多态性(SNPs)等分子特征数据,支持抗菌药物耐药性的机器学习预测研究。

文件详解

  • Metadata.zip
  • phenotypes.txt:表格文件,记录基于CLSI指南的二元耐药表型数据,行代表菌株,列对应不同药物;字段取值说明:耐药=1、敏感=0、缺失=中介耐药
  • Features_gpa_exp_snps.zip
  • genexp(基因表达表目录)
  • genexp_feature_vect.npz:Numpy压缩格式的特征矩阵
  • genexp_feature_list.txt:特征矩阵的列标签(特征)
  • genexp_strains_list.txt:特征矩阵的行标签(菌株)
  • gpa(基因存在/缺失表目录)
  • gpa_feature_vect.npz:Numpy压缩格式的特征矩阵
  • gpa_feature_list.txt:特征矩阵的列标签(特征)
  • gpa_strains_list.txt:特征矩阵的行标签(菌株)
  • snps(SNPs表目录)
  • snps_feature_vect.npz:Numpy压缩格式的特征矩阵
  • snps_feature_list.txt:特征矩阵的列标签(特征)
  • snps_strains_list.txt:特征矩阵的行标签(菌株)
  • REAME.md:说明文档(未提供预览内容)

适用场景

  • 微生物耐药性研究:分析铜绿假单胞菌对不同抗菌药物的耐药机制
  • 机器学习模型构建:基于分子特征预测细菌耐药表型的算法开发
  • 分子诊断应用:探索抗菌药物耐药性快速检测的分子标记物
  • 临床药学研究:为抗菌药物合理使用及耐药防控提供数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 26.43 MiB
最后更新 2025年12月15日
创建于 2025年12月15日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。