数据集概述
本数据集为关于铜绿假单胞菌PAO1中c-di-GMP代谢蛋白PA2072的研究数据,包含相对c-di-GMP浓度、qRT-PCR、RNA-seq、铁载体产生等多类实验原始数据,支持相关生物学功能分析。
文件详解
- 原始数据文件(位于Original Data/目录下):
- relative c-di-GMP concentration.xlsx:Excel格式,记录相对c-di-GMP浓度数据
- Raw data of qRT-PCR.xlsx:Excel格式,qRT-PCR原始数据
- Pyochelin production.pzf:pzf格式,绿脓菌素产生相关数据
- qRT-PCR data.pzf:pzf格式,qRT-PCR数据
- Siderophore production.pzf:pzf格式,铁载体产生数据
- Swimming motility data.pzf:pzf格式,泳动数据
- Twitching motility data.pzf:pzf格式,蹭动数据
- β-gal activity data.pzf:pzf格式,β-半乳糖苷酶活性数据
- RNA-seq数据文件(位于Original Data/RNA-seq data/目录下):
- heatmap data.xlsx:Excel格式,热图数据
- DEG-Ven子目录文件(位于RNA-seq data/DEG-Ven/目录下):
- 包含pa2072-VS-WT.List.xls等多个xls格式文件,记录不同实验组与野生型的差异表达基因列表
- GO enrichment子目录文件(位于RNA-seq data/GO enrichment/目录下):
- 包含-pa2072chase4-vsWT- biological process.xlsx等多个Excel格式文件,记录基因本体富集分析数据
适用场景
- 细菌分子生物学研究:分析PA2072蛋白对c-di-GMP代谢的调控机制
- 微生物生理学研究:探究PA2072对铜绿假单胞菌运动性、铁载体产生等表型的影响
- 转录组学分析:研究PA2072相关差异表达基因及功能富集
- 细菌信号通路研究:解析c-di-GMP信号通路与PA2072的关联机制