数据集概述
本数据集记录了通过空间和功能靶向肿瘤微环境中调节性T细胞(Treg)以诱导强效抗肿瘤免疫并逆转CD8 T细胞耗竭的研究实验数据。内容包含从野生型(WT)和基因敲除(KO)小鼠中分离的Treg细胞RNA测序及下游分析结果,涉及基因表达矩阵、差异表达基因列表、目标基因列表及可视化代码,总计4个文件。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:interested_gene_list.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含研究关注的目标基因列表
- 文件名称:expression.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含基因表达FPKM矩阵数据
- 文件名称:KOvsWT.all genes.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:包含KO小鼠与WT小鼠的差异表达基因(DEG)列表
- 代码文件
- 文件名称:visualization code.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于数据可视化分析的R代码文件
适用场景
- 肿瘤免疫机制研究: 分析靶向Treg细胞对CD8 T细胞耗竭状态及抗肿瘤免疫的影响机制
- 免疫治疗靶点筛选: 基于差异表达基因列表挖掘潜在的肿瘤免疫治疗靶点
- 基因表达数据分析: 利用FPKM矩阵开展肿瘤微环境中基因表达模式研究
- 生物信息学可视化: 通过R代码实现基因表达及差异分析结果的可视化呈现