数据集概述
本数据集围绕白三叶草氰化作用多态性的分子进化展开,包含与Ac/ac和Li/li两个基因位点相关的序列比对、GenBank登录信息及说明文档。通过分析65株植物的基因侧翼序列,探究基因缺失多态性的进化机制,为适应性进化研究提供数据支持,共含4个文件。
文件详解
- README文档
- 文件名称:
README_for_GenBank Accession Information.rtf
- 文件格式:RTF
- 字段映射介绍:说明数据集包含的文件清单及各文件内容概述,如基因位点序列比对文件的描述。
- GenBank登录信息表
- 文件名称:
GenBank Accession Information.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录与研究相关的基因序列在GenBank数据库中的登录信息,可能包含登录号、序列来源等字段。
- 基因位点序列比对文件(Ac/ac相关)
- 文件名称:
3CYP_2.34.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:3CYP_2.34基因位点的序列比对数据,用于分析该位点的分子进化特征。
- 基因位点序列比对文件(Li/li相关)
- 文件名称:
3Li_6.65.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:3Li_6.65基因位点的序列比对数据,用于分析该位点的分子进化特征。
数据来源
论文“Recurrent gene deletions and the evolution of adaptive cyanogenesis polymorphisms in white clover (Trifolium repens L.)”
适用场景
- 植物分子进化研究: 分析白三叶草Ac/ac和Li/li基因位点的缺失多态性进化机制。
- 适应性进化机制探究: 研究基因存在/缺失变异在适应性进化中的作用及遗传机制。
- 基因序列比对分析: 利用NEX格式的序列比对文件开展基因序列进化特征研究。
- 植物化学防御多态性分析: 结合氰化作用相关基因数据,探讨植物化学防御系统的进化规律。