数据集概述
本数据集为特立尼达西印度群岛Haemagogus蚊病毒组研究的相关文件,包含11个文件,涵盖植物病毒、昆虫特异性病毒、蚊相关病毒等多种病毒的Contig序列,以及潜在宿主动物线粒体序列列表和关联表格,支持蚊媒病毒组的特征分析研究。
文件详解
- 病毒Contig序列文件(.fasta格式,共10个)
- 文件名称:Contig_of_plant_virus.fasta、Contigs_of_known_insect_specific-viruses.fasta、Contigs_of_other_viruses.fasta、Wolbachia_Contigs_assembled_from_reads_mapped_to_Silva_16S_Database.fasta、Contigs_assembled_from_reads_mapped_to_Mt_Sequences_of_potential_feeding_hosts.fasta、Contigs_of_mosquito_associated_viruses.fasta、Mt_sequences_of_potential_bird_feeding_hosts.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:存储不同类型病毒或微生物的Contig核苷酸序列,包含序列ID和对应的碱基序列信息
- 文档文件(.docx格式,共1个)
- 文件名称:List_of_Mt_sequences_of_potential_host_animals_used_for_mapping_RNA_seq.docx、Table_HV_1
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:记录用于RNA-seq映射的潜在宿主动物线粒体序列列表及关联研究表格
数据来源
Trinidad Haemagogus Virome Project
适用场景
- 蚊媒病毒组特征分析:解析特立尼达Haemagogus蚊携带的病毒种类、丰度及遗传特征
- 病毒宿主关联研究:通过潜在宿主线粒体序列,探究蚊媒病毒与宿主动物的相互关系
- 病毒分类与进化分析:基于不同类型病毒的Contig序列,开展病毒分类学及进化树构建研究
- 蚊媒传染病风险评估:为特立尼达地区蚊媒传播病毒的流行风险提供数据支撑