数据集概述
本数据集围绕TRPM4离子通道在前列腺癌中的作用展开,包含基因表达分析、肿瘤球实验及斑马鱼模型实验相关数据。通过GEO2R平台分析15例前列腺癌患者组织样本的基因表达,验证TRPM4在癌组织中显著上调;同时记录TRPM4缺失对前列腺癌肿瘤球大小、生长及细胞死亡的影响,以及对斑马鱼模型中外渗和转移的作用。数据集共6个文件,支持TRPM4作为前列腺癌治疗靶点的研究。
文件详解
- 基因表达分析文件
- 文件名称:Figure 1_GSE69223.tsv
- 文件格式:TSV
- 字段映射介绍:包含基因ID(ID)、校正P值(adj.P.Val)、P值(P.Value)、t值(t)、B值(B)、对数倍数变化(logFC)、基因符号(Gene.symbol)、基因标题(Gene.title)等字段,记录正常与恶性前列腺组织中基因表达差异分析结果,其中TRPM4为显著上调基因。
- 实验结果文件
- 文件名称:Figure 1.xlsx、Figure 2.xlsx、Figure 3.xlsx、Figure 4.xlsx、SFig1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含前列腺癌肿瘤球大小、生长情况、细胞死亡数据,以及斑马鱼模型中外渗和转移负担的实验结果,具体字段需结合实验内容对应(如肿瘤球直径、细胞存活率、转移灶数量等)。
数据来源
论文“TRPM4 contributes to cell death in prostate cancer tumor spheroids, and to extravasation and metastasis in a zebrafish xenograft model system”
适用场景
- 前列腺癌基因表达研究: 分析TRPM4在正常与恶性前列腺组织中的表达差异,探索其作为生物标志物的潜力。
- 肿瘤球实验分析: 研究TRPM4缺失对前列腺癌肿瘤球生长、大小及细胞死亡的影响,验证其在三维细胞模型中的功能。
- 斑马鱼模型转移研究: 利用TRPM4缺失后斑马鱼模型的外渗和转移数据,分析其在前列腺癌转移中的作用机制。
- 离子通道靶向治疗研究: 评估TRPM4作为前列腺癌治疗靶点的可行性,为药物开发提供实验依据。
- 细胞信号通路分析: 结合TRPM4对细胞增殖、迁移、钙信号等的影响,探索其调控的细胞信号通路。