数据集概述
本数据集聚焦布氏锥虫抗原变异机制研究,包含锥虫变异表面糖蛋白(VSG)的表达数据,涉及感染过程中VSG变异模式、嵌合VSG的形成及基因转换现象。数据源于小鼠感染实验的纵向VSG cDNA测序,可用于分析抗原变异多样性及慢性感染中的变异特征,共包含4个相关文件。
文件详解
- Hall2013_ReadMe.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含研究背景、文件清单及数据收集方法(小鼠感染实验、血液样本采集、RNA反转录流程等)
- Hall2013_ExpressedBasicCopies.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件,推测包含表达的基础VSG拷贝序列或相关基础数据
- Hall2013_ExpressedClones.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:Excel表格,推测包含表达的VSG克隆序列、变异类型或样本对应关系等结构化数据
- Hall2013_ExpressedAlignments.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件,推测包含VSG序列比对结果数据
数据来源
论文“Mosaic VSGs and the scale of Trypanosoma brucei antigenic variation”
适用场景
- 寄生虫免疫学研究:分析布氏锥虫VSG抗原变异模式与宿主免疫逃逸机制
- 基因变异机制研究:探究嵌合VSG的基因转换来源及伪基因对变异的贡献
- 慢性感染机制分析:通过纵向数据研究慢性感染中锥虫抗原多样性的动态变化
- 分子寄生虫学实验设计:参考小鼠感染模型及VSG测序方法,指导相关实验设计