数据集概述
本数据集包含支持论文《Soil bacterial neutral lipid fatty acids: Markers for carbon storage or necromass?》的实验数据与分析代码,涉及PLFA/NLFA分析、JGI基因搜索及13C标记葡萄糖添加实验相关数据与R脚本,为土壤细菌脂质脂肪酸功能研究提供数据支撑。
文件详解
数据集包含3个压缩包文件,具体说明如下:
- Fig_2_3.zip:
- 包含文件:soil_area.csv(TIC面积数据)、soil_weights.csv(提取重量与转移校正数据)、soil_phylum.csv(甲基化校正及脂肪酸特异性数据)、Fig_2_3.R(生成图2、图3及表2的R脚本)
- 涉及内容:土壤PLFA与NLFA数据分析及绘图
- Fig_5.zip:
- 包含文件:Bacteria_soil_all.txt(JGI数据库土壤细菌分离株数据)、Bacteria_soil_pfam06974_WSDGAT.txt等基因搜索结果文件、NCBI_species_names.csv(物种ID与名称数据)、Fig_5.R(生成图5及表4的R脚本)
- 涉及内容:JGI IMG/M ER基因搜索数据及系统发育树分析
- Fig_6.zip:
- 包含文件:nmolC.csv(绝对丰度数据)、atp.csv(13C富集数据)、phylum.csv(脂肪酸分类数据)、Fig_6.R(生成图6的R脚本)
- 涉及内容:13C标记葡萄糖添加实验数据分析及绘图
适用场景
- 土壤微生物学研究:分析土壤细菌中性脂质脂肪酸的碳储存功能与坏死物质标记作用
- 生物信息学分析:探究土壤细菌WS/DGAT、DAGAT等基因的分布特征
- 稳定同位素示踪研究:解析13C标记葡萄糖在土壤微生物群落中的代谢途径
- 生态功能评估:评估土壤微生物群落对碳源添加的响应机制