TvLF_Based_阴道毛滴虫细菌基因簇横向转移研究数据

数据集概述

本数据集围绕阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis)基因组中一个长度为34kbp、包含27个原核生物来源基因的独特簇(TvLF)展开,支持对真核生物横向基因转移(LGT)机制的研究。数据验证了该基因簇在多株阴道毛滴虫中的存在,揭示其可能来源于近期单次LGT事件,为分析基因获取后的演化命运提供依据。

文件详解

  • 文件名称:TvLFphylogenetic_data.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包包含与TvLF基因簇系统发育分析相关的数据,具体内容未提供预览,但推测涵盖基因序列、系统发育树构建所需的比对文件、菌株验证PCR数据等支持横向基因转移研究的核心信息。

数据来源

论文“A recently transferred cluster of bacterial genes in Trichomonas vaginalis –lateral gene transfer and the fate of acquired genes”

适用场景

  • 真核生物横向基因转移机制研究: 分析TvLF基因簇的来源、转移时间及在阴道毛滴虫基因组中的固定过程。
  • 原核生物与真核生物基因交流分析: 探究Firmicutes门细菌(如Peptoniphilus harei)与阴道毛滴虫之间的基因转移关系。
  • 基因簇演化命运研究: 追踪TvLF中基因的假基因化、降解过程,揭示获取基因的适应性筛选机制。
  • 寄生虫基因组动态分析: 以阴道毛滴虫为例,研究寄生原生生物基因组通过LGT获得功能基因的模式与影响。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.23 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
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