数据集概述
本数据集为草原松鸡免疫基因研究数据，包含主要组织相容性复合体（MHC）等免疫受体基因与免疫介导基因的序列、基因型及种群比较数据，用于验证不同功能免疫基因在选择与遗传漂变上的差异假设，涉及9个相关文件。
文件详解
- 序列与基因型文件
- 文件名称：T. cupido MHC class II sequences alignment.fasta、T. cupido MHC class IA sequences alignment.fasta、MHC class I genotypes.txt、MHC class II genotypes.txt
- 文件格式：FASTA、TXT
- 字段映射介绍：包含MHC I类、II类基因的序列比对数据及基因型信息
- 种群比较与图表数据
- 文件名称：T. cupido pairwise population comparisons.txt、Data for Fig1.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录草原松鸡种群间的距离、遗传标记差异值等比较数据及图表1对应的数据
- 样本与坐标文件
- 文件名称：README_for_Sequences from 454 pyrosequencing.csv、GPS coordinates for populations.txt、Sequences from 454 pyrosequencing.zip
- 文件格式：CSV、TXT、ZIP
- 字段映射介绍：CSV含MHC类型、条形码序列及样本ID；TXT含种群GPS坐标；ZIP为454焦磷酸测序序列压缩包
数据来源
论文“Contrasting patterns of selection and drift between two categories of immune genes in prairie-chickens”
适用场景
- 野生动物遗传学研究: 分析草原松鸡免疫基因的种群分化与局部适应机制
- 进化生物学分析: 比较免疫受体基因与介导基因的选择强度及遗传漂变效应差异
- 种群生态学研究: 结合GPS坐标与种群比较数据，探究地理距离对免疫基因分化的影响
- 分子免疫学研究: 基于MHC序列与基因型数据，研究草原松鸡免疫基因的进化规律
